已经分开了两年了。没住在一起，我现在想申请离婚。?

您可以申请离婚，分居两年是感情破裂的法定情形。根据《民法典》，因感情不和分居满二年可确认感情破裂，是诉讼离婚的依据。不及时处理可能导致财产分割、子女抚养权等权益受损。
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离婚方式有协议和诉讼两种。若双方自愿且能协商一致，可选择协议离婚；若存在争议或一方不同意，则应选择诉讼离婚，通过法院裁决。
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可申请离婚。操作如下：1. 协议离婚：双方协商后签订书面协议，共同到婚姻登记机关办理。2. 诉讼离婚：准备感情破裂证据，如分居证明，向法院提起诉讼，等待法院调解或判决。